30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2755 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  77.6 
 
 		 187 aa  298  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  77.05 
 
 		 199 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  69.06 
 
 		 185 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  69.1 
 
 		 185 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  62.43 
 
 		 198 aa  234  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  57.3 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  55.62 
 
 		 196 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  56.63 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  53.85 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  49.38 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  43.75 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 181 aa  134  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  32.04 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  32.95 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 225 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>