More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0254 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 
279 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.63 
 
 
279 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.65 
 
 
279 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  80.65 
 
 
285 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.65 
 
 
279 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.28 
 
 
279 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  62.37 
 
 
279 aa  324  8.000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  61.99 
 
 
284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  61.99 
 
 
284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  61.99 
 
 
284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.64 
 
 
275 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  63.64 
 
 
275 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  63.26 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  63.85 
 
 
275 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  63.85 
 
 
275 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  63.85 
 
 
275 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  62.88 
 
 
275 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  62.88 
 
 
275 aa  300  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  68.02 
 
 
283 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  68.64 
 
 
253 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  68.64 
 
 
283 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  68.02 
 
 
283 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  68.02 
 
 
253 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  64.23 
 
 
275 aa  296  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  68.64 
 
 
285 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  67.4 
 
 
275 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  62.6 
 
 
283 aa  292  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  60.85 
 
 
272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  60.85 
 
 
272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  54.58 
 
 
282 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.1 
 
 
306 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  54.48 
 
 
306 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.49 
 
 
275 aa  255  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.39 
 
 
275 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.24 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  54.4 
 
 
283 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.36 
 
 
301 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  49.6 
 
 
330 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.54 
 
 
306 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.04 
 
 
293 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  51.61 
 
 
261 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.6 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.41 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.6 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.21 
 
 
296 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  52 
 
 
289 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.62 
 
 
284 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.63 
 
 
272 aa  214  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0949532  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  50.4 
 
 
320 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.88 
 
 
321 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.25 
 
 
280 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.7 
 
 
412 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.86 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.86 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.86 
 
 
269 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.13 
 
 
284 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
255 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
257 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
257 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  43.58 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
430 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00472137  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
283 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
277 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  42.52 
 
 
288 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
286 aa  175  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  43.04 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  37.5 
 
 
279 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
288 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.49 
 
 
256 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  37.12 
 
 
279 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
256 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
273 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  39.66 
 
 
262 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  40.08 
 
 
262 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1867  ABC transporter permease  38.24 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.77 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.154719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
268 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 
274 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
254 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.51 
 
 
294 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 
273 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
260 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.011116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
252 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
291 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
272 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88893  normal  0.0504928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
276 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.46 
 
 
277 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
268 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
255 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1975  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.93 
 
 
267 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  39.5 
 
 
280 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
272 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4139  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.96 
 
 
275 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314222  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30490  aliphatic sulfonate ABC transporter permease protein  40.34 
 
 
264 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168678  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5468  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  38.4 
 
 
284 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>