40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0149 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  53.88 
 
 		 758 aa  772    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  100 
 
 		 727 aa  1508    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  52.76 
 
 		 539 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  39.83 
 
 		 726 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  24.49 
 
 		 641 aa  107  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  32.88 
 
 		 357 aa  70.5  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  32.03 
 
 		 378 aa  63.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  33.09 
 
 		 324 aa  60.1  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  29.61 
 
 		 277 aa  60.1  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  29.8 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  32.45 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  32.54 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  30.41 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  30.41 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  30.41 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  30.41 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  32.06 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  32.06 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  28.05 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  29.73 
 
 		 240 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  29.73 
 
 		 240 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  30.77 
 
 		 240 aa  57  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  29.73 
 
 		 240 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  30.41 
 
 		 240 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  29.73 
 
 		 240 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  29.85 
 
 		 379 aa  54.3  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  36.94 
 
 		 234 aa  54.3  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29272  predicted protein  36.47 
 
 		 550 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  32.82 
 
 		 299 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  33.1 
 
 		 336 aa  50.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  29.03 
 
 		 404 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  29.11 
 
 		 258 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  28.08 
 
 		 387 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  28.08 
 
 		 387 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60390  triacylglycerol lipase  25.67 
 
 		 313 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  28 
 
 		 276 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5847  lipase class 3  28.4 
 
 		 383 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0728  hypothetical protein  26.38 
 
 		 371 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24393  predicted protein  35.06 
 
 		 694 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28505  triacylglycerol lipase precursor  27.59 
 
 		 350 aa  44.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>