27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2464 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2464  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.541836  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  39.68 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  26.48 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  26.12 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  29.52 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  25.94 
 
 		 566 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  27.04 
 
 		 570 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  26.2 
 
 		 570 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  26.1 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  25.21 
 
 		 559 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0849  putative outer membrane protein  29.15 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  29.49 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  24.05 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  29.03 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  26.21 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4129  putative outer membrane protein  27.78 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  28.05 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0284  putative outer membrane protein  27.78 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.77 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.08 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  26.11 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  27.4 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  25.19 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  25 
 
 		 562 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  26.23 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  26.46 
 
 		 452 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  30.09 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>