28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2128 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  273  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  64.66 
 
 		 134 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  66.93 
 
 		 131 aa  179  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  63.91 
 
 		 133 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  63.91 
 
 		 133 aa  176  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  65.62 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  63.57 
 
 		 141 aa  163  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  63.08 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  58.02 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  55.73 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  57.25 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  56.82 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  56.82 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  56.06 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  56.49 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  53.97 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  54.33 
 
 		 139 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  51.24 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  39.53 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  36.8 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  26.72 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4466  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.545567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  25 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1634  hypothetical protein  31.78 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1161  protein of unknown function DUF1486  25.2 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  26.52 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  31.5 
 
 		 158 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  26.72 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>