More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1594 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1594  polyphosphate kinase  100 
 
 		 433 aa  887    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1302  polyphosphate kinase  98.25 
 
 		 721 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0781  polyphosphate kinase  72.4 
 
 		 728 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2437  polyphosphate kinase  72.4 
 
 		 728 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0297937  normal  0.018085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1058  polyphosphate kinase  70.31 
 
 		 724 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0398  polyphosphate kinase  71.43 
 
 		 729 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0740  polyphosphate kinase  69.43 
 
 		 724 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2161  polyphosphate kinase  58.95 
 
 		 754 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3326  polyphosphate kinase  57.14 
 
 		 735 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2551  polyphosphate kinase  58.56 
 
 		 742 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.183316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0037  polyphosphate kinase  58.11 
 
 		 721 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.859837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3458  polyphosphate kinase  55.41 
 
 		 736 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  55.86 
 
 		 733 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2952  polyphosphate kinase  55.86 
 
 		 759 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  54.55 
 
 		 724 aa  263  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1568  polyphosphate kinase  52.89 
 
 		 813 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246522  normal  0.10605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5543  polyphosphate kinase  56.82 
 
 		 750 aa  260  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3127  polyphosphate kinase  57.87 
 
 		 726 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3849  polyphosphate kinase  54.95 
 
 		 731 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2329  polyphosphate kinase  54.5 
 
 		 736 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52981  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5160  polyphosphate kinase  55.91 
 
 		 749 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536085  normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0206  polyphosphate kinase  54.87 
 
 		 801 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.199737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2115  polyphosphate kinase  53.15 
 
 		 741 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.311137  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1594  polyphosphate kinase  52.7 
 
 		 733 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338059  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1119  polyphosphate kinase  55.45 
 
 		 754 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.439872  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1754  polyphosphate kinase  52.14 
 
 		 722 aa  249  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.048645  normal  0.328286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0494  polyphosphate kinase  55.91 
 
 		 790 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.502952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0795  polyphosphate kinase  54.02 
 
 		 736 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  normal  0.829527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2341  polyphosphate kinase  52.73 
 
 		 788 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2027  polyphosphate kinase  53.18 
 
 		 788 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632434  normal  0.646529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2067  polyphosphate kinase  52.73 
 
 		 788 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177441  normal  0.0413655 
 
 
-
 
NC_004310  BR0748  polyphosphate kinase  53.81 
 
 		 746 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  51.54 
 
 		 753 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0742  polyphosphate kinase  53.81 
 
 		 746 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2544  polyphosphate kinase  53.81 
 
 		 764 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106279  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1098  polyphosphate kinase  52.47 
 
 		 734 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938233  normal  0.038418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1244  polyphosphate kinase  52.47 
 
 		 734 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  hitchhiker  0.00511453 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  52.36 
 
 		 727 aa  236  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0233  polyphosphate kinase  53.99 
 
 		 764 aa  231  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.61377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2654  polyphosphate kinase  53.18 
 
 		 736 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1035  polyphosphate kinase  46.27 
 
 		 713 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988005  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  38.83 
 
 		 721 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5250  polyphosphate kinase  45.62 
 
 		 736 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  41.26 
 
 		 720 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1891  polyphosphate kinase  44.81 
 
 		 703 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  41.52 
 
 		 722 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  41.52 
 
 		 722 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0300  polyphosphate kinase  45.41 
 
 		 727 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0293  polyphosphate kinase  45.62 
 
 		 736 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5217  polyphosphate kinase  43.32 
 
 		 727 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5278  polyphosphate kinase  43.32 
 
 		 747 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  43.32 
 
 		 747 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  43.32 
 
 		 746 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  43.72 
 
 		 693 aa  176  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  48.39 
 
 		 688 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5464  polyphosphate kinase  44.44 
 
 		 741 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  42.23 
 
 		 731 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  41.44 
 
 		 736 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  45.62 
 
 		 736 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  45.88 
 
 		 762 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  45.6 
 
 		 714 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  45.16 
 
 		 736 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  47.45 
 
 		 765 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  46.7 
 
 		 744 aa  170  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2388  polyphosphate kinase  42.03 
 
 		 690 aa  170  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  41.78 
 
 		 710 aa  169  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  42.93 
 
 		 731 aa  170  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  40.47 
 
 		 740 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  44.39 
 
 		 720 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  37.64 
 
 		 721 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  45.88 
 
 		 745 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0266  Polyphosphate kinase  37.01 
 
 		 691 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2851  polyphosphate kinase  44 
 
 		 687 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  43.78 
 
 		 690 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  45.08 
 
 		 707 aa  166  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  40.95 
 
 		 700 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  42.11 
 
 		 693 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1273  polyphosphate kinase  44 
 
 		 687 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822681  normal  0.156597 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2161  polyphosphate kinase  43.26 
 
 		 720 aa  166  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  39.25 
 
 		 743 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  41.71 
 
 		 702 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  43.26 
 
 		 708 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  41.97 
 
 		 700 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  42.35 
 
 		 709 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2178  polyphosphate kinase  41.84 
 
 		 693 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.539931  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  40.29 
 
 		 695 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  42.35 
 
 		 709 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1022  polyphosphate kinase  42.71 
 
 		 697 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.665381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  42.33 
 
 		 708 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2160  polyphosphate kinase  39.07 
 
 		 694 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  43.75 
 
 		 703 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2072  polyphosphate kinase  42.79 
 
 		 698 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  44.78 
 
 		 766 aa  161  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0890  polyphosphate kinase  43.5 
 
 		 687 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0570099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2279  polyphosphate kinase  38.26 
 
 		 693 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311481  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  41.29 
 
 		 713 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  45 
 
 		 691 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  43.39 
 
 		 694 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1603  Polyphosphate kinase  39.51 
 
 		 705 aa  160  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0875  polyphosphate kinase  38.1 
 
 		 696 aa  160  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.458341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>