More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1251 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  100 
 
 		 284 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  71.99 
 
 		 285 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  69.49 
 
 		 274 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  65.09 
 
 		 277 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  65.45 
 
 		 277 aa  358  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  64 
 
 		 277 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  64 
 
 		 277 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  62.32 
 
 		 277 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  64.47 
 
 		 279 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  67.28 
 
 		 274 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  60.81 
 
 		 287 aa  349  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  66.91 
 
 		 274 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  62.32 
 
 		 287 aa  340  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  64 
 
 		 280 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  60.95 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  60.95 
 
 		 295 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  58.18 
 
 		 276 aa  335  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  61.4 
 
 		 297 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  60.42 
 
 		 285 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  57.09 
 
 		 276 aa  332  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  57.09 
 
 		 276 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  59.01 
 
 		 285 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 291 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  60.65 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  58.67 
 
 		 279 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  57.93 
 
 		 279 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  62.41 
 
 		 276 aa  315  7e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  59.34 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  54.51 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  54.29 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  54.64 
 
 		 301 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  54.35 
 
 		 292 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  53.93 
 
 		 304 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  53.93 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  53.93 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  53.93 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  54.15 
 
 		 304 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  54.95 
 
 		 286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  53.24 
 
 		 296 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  54.95 
 
 		 281 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  56.23 
 
 		 276 aa  277  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  52.71 
 
 		 291 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  50.75 
 
 		 278 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  53.26 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  53.26 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  52 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  53.26 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  53.26 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.7 
 
 		 357 aa  263  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  52.9 
 
 		 293 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  52.9 
 
 		 293 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  52.54 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1695  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.45 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000898255 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2965  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.95 
 
 		 338 aa  258  8e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.26 
 
 		 329 aa  257  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0503612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1712  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.45 
 
 		 320 aa  257  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000540803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  48.53 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  48.53 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  45.59 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.53 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2854  putative oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.94 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.609157  normal  0.248149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1998  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 		 333 aa  255  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.120304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.43 
 
 		 347 aa  255  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0631  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.72 
 
 		 321 aa  255  6e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.575806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.35 
 
 		 322 aa  255  7e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.173398 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4105  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 		 347 aa  254  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1812  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.37 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2439  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.45 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.87 
 
 		 342 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0418  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.38 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755562  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.46 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.08 
 
 		 320 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000196447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1063  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.06 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.75 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0012  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.44 
 
 		 328 aa  249  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1733  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.13 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4477  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 		 326 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.178074  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0193  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.39 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3854  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.08 
 
 		 346 aa  249  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.403514  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4210  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.58 
 
 		 345 aa  248  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2723  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.43 
 
 		 324 aa  248  8e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  0.451475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3820  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.96 
 
 		 345 aa  248  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.135433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1003  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 		 330 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0825  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 		 330 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1883  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.25 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5352  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  49.81 
 
 		 350 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3308  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  50.38 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0810  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 		 330 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1915  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.67 
 
 		 338 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0882054  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.35 
 
 		 342 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.467741  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0999  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2146  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1864  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.12 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429685  normal  0.131227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>