287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2608 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2608  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  40.62 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1665  protein of unknown function DUF59  30.84 
 
 		 132 aa  67  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.670958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  35.71 
 
 		 108 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1951  hypothetical protein  37.63 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0541  hypothetical protein  34 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0982669  normal  0.227881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  35.09 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  33.09 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  38.54 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  37.76 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  33.65 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  37.76 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  37.76 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  36.36 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  37.76 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  37.76 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  37.76 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  34.38 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  31.91 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  36.73 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  32.62 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  35.24 
 
 		 112 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2619  protein of unknown function DUF59  35.71 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.830431  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  34.83 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  35.11 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  36.36 
 
 		 100 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1486  hypothetical protein  36.96 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0634808 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  30.53 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  30.53 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  41.77 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  35.11 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6280  hypothetical protein  36.78 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0596965  normal  0.273868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0339  protein of unknown function DUF59  34.17 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  32.69 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  32.32 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  28.16 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  35 
 
 		 112 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0351  protein of unknown function DUF59  33.96 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  31.07 
 
 		 120 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  34.31 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  35.96 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  33.7 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  32.29 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  38.78 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  34.41 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  36.05 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  34.83 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0701  protein of unknown function DUF59  32.67 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2201  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  34.44 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124529  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  31.25 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0600  hypothetical protein  30.1 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1949  hypothetical protein  30.1 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  32.98 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  30.1 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  30.61 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  38.37 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1701  hypothetical protein  38.54 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.782765  normal  0.0606512 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  30 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  35 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  30.43 
 
 		 99 aa  53.9  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2523  hypothetical protein  32.04 
 
 		 120 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088034  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  33.98 
 
 		 118 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  34.48 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2095  hypothetical protein  34.69 
 
 		 127 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.669364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  28.74 
 
 		 108 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  36.08 
 
 		 106 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  36.9 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  34.88 
 
 		 126 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  36.05 
 
 		 126 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  26 
 
 		 102 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  35.96 
 
 		 102 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  27.47 
 
 		 160 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  33.68 
 
 		 108 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  31.11 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  36.9 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  35.96 
 
 		 102 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0925  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  52.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  35.56 
 
 		 135 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  32.69 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  28.12 
 
 		 135 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  34.88 
 
 		 126 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  34.88 
 
 		 139 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0601  putative metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  33.33 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  27.66 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0453  serine O-acetyltransferase  34.02 
 
 		 315 aa  52.4  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  28.43 
 
 		 108 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  34.04 
 
 		 122 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1848  hypothetical protein  34.69 
 
 		 131 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.180623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  36.14 
 
 		 105 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  31.11 
 
 		 107 aa  52.4  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  36.54 
 
 		 121 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  35.63 
 
 		 104 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.71 
 
 		 105 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3821  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaJ subunit  34.69 
 
 		 152 aa  51.6  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134466  normal  0.475873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1175  hypothetical protein  27.18 
 
 		 107 aa  51.6  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  36.36 
 
 		 102 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>