21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1094 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1094  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1916  hypothetical protein  43.9 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1905  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0376  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000453716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0283  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0478  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4570  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5937  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496478  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5997  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.18 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1067  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.753603 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0705  Cro/CI family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9645  hypothetical protein  38.89 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.085349  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  35.82 
 
 		 488 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3396  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 97 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158475 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0557  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.948289 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>