More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0189 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0189  acetolactate synthase large subunit  100 
 
 		 580 aa  1194    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2560  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  65.86 
 
 		 573 aa  791    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000271615  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1266  acetolactate synthase large subunit  42.33 
 
 		 602 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.02 
 
 		 562 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.89 
 
 		 557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0410  acetolactate synthase large subunit  27.83 
 
 		 550 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000680681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.74 
 
 		 548 aa  213  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.06 
 
 		 548 aa  213  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.18 
 
 		 554 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.95 
 
 		 548 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4760  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.55 
 
 		 548 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.56 
 
 		 548 aa  208  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.11 
 
 		 548 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.11 
 
 		 548 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.11 
 
 		 548 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.11 
 
 		 548 aa  207  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.85 
 
 		 558 aa  206  7e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.11 
 
 		 548 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.3 
 
 		 561 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.64 
 
 		 569 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.16 
 
 		 557 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.74 
 
 		 548 aa  204  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.74 
 
 		 548 aa  204  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  28.03 
 
 		 599 aa  203  6e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.68 
 
 		 554 aa  203  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.74 
 
 		 548 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.74 
 
 		 548 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.69 
 
 		 548 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  27.16 
 
 		 562 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.57 
 
 		 548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.55 
 
 		 620 aa  201  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  28.57 
 
 		 548 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  28.57 
 
 		 548 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.57 
 
 		 548 aa  200  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4031  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.22 
 
 		 557 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.81 
 
 		 562 aa  200  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.07 
 
 		 582 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3934  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.22 
 
 		 557 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4128  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.22 
 
 		 557 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  28.52 
 
 		 569 aa  199  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.82 
 
 		 535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3414  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.12 
 
 		 557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.02 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4009  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.04 
 
 		 557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.96 
 
 		 602 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0362  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.07 
 
 		 557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3664  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.22 
 
 		 551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.66 
 
 		 557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  29.44 
 
 		 562 aa  198  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.75 
 
 		 612 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0356  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.07 
 
 		 557 aa  198  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13507  acetolactate synthase large subunit ilvB2  28.64 
 
 		 552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.38 
 
 		 563 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  26.83 
 
 		 555 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.88 
 
 		 588 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.23 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.35 
 
 		 632 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0422  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.55 
 
 		 555 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4347  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.9 
 
 		 552 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3614  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.75 
 
 		 557 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2114  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.45 
 
 		 565 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.98 
 
 		 557 aa  194  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3951  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.23 
 
 		 574 aa  194  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  27.24 
 
 		 566 aa  194  5e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  28.03 
 
 		 581 aa  193  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4843  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.75 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  28.4 
 
 		 562 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  28.4 
 
 		 562 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  28.4 
 
 		 562 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  28.4 
 
 		 562 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  28.4 
 
 		 562 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  26.93 
 
 		 587 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.52 
 
 		 636 aa  191  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  28.16 
 
 		 550 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  27.83 
 
 		 577 aa  191  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.5 
 
 		 586 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0114  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  27.15 
 
 		 589 aa  190  5e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.98 
 
 		 619 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.88 
 
 		 555 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.57 
 
 		 557 aa  189  9e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  28.15 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  26.93 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.23 
 
 		 569 aa  189  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.05 
 
 		 569 aa  189  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  27.41 
 
 		 638 aa  189  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0662  acetolactate synthase, large subunit  28.86 
 
 		 553 aa  189  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0231424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28 
 
 		 564 aa  188  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4061  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.24 
 
 		 548 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0482  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.08 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3281  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.17 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0154  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.08 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  26.93 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8059  acetolactate synthase, large subunit  28.39 
 
 		 578 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.1 
 
 		 552 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0706  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.86 
 
 		 581 aa  188  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.96 
 
 		 593 aa  188  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.2 
 
 		 619 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  27.8 
 
 		 562 aa  187  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.99 
 
 		 620 aa  186  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  27.83 
 
 		 567 aa  186  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>