49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1913 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1913  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.77 
 
 		 441 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  40.54 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  37.84 
 
 		 149 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1693  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  26.7 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  42.67 
 
 		 440 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.1 
 
 		 374 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  30.07 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.55 
 
 		 640 aa  44.7  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2242  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  25.32 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.156652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2166  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  37.04 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.97 
 
 		 349 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2300  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  37.33 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63514  normal  0.746054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03381  Ubiquinol-cytochrome C reductase iron-sulfur subunit  30.3 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1962  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  30.18 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.71 
 
 		 330 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0520  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  34.85 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.701986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3377  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  33.73 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.719786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  34.86 
 
 		 346 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.56 
 
 		 355 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1384  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  37.14 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57570  putative cytochrome c reductase, iron-sulfur subun  30.3 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00425374  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2760  hypothetical protein  28.07 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2633  hypothetical protein  28.07 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.44 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3801  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  29.03 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1208  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.75 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5003  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  30.3 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000329948  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2662  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit (rieske iron-sulfur protein)  26.95 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0104541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1794  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.83 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452271  normal  0.628194 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  36.99 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0512  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  35.94 
 
 		 187 aa  42  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00341005  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  35.14 
 
 		 170 aa  42  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0519  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.78 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 		 356 aa  41.6  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2527  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.1 
 
 		 232 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.513759  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0097  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  40.82 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3205  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  35.44 
 
 		 217 aa  41.2  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  35.71 
 
 		 345 aa  41.2  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.03 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  29.9 
 
 		 220 aa  41.2  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0809  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  42.22 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000022763  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1814  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  30.34 
 
 		 167 aa  41.2  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.141973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3241  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  36.51 
 
 		 175 aa  40.8  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>