287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3665 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3665  Mg2+ transporter protein, CorA-like  100 
 
 		 329 aa  672    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00199439  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0935  Mg2+ transporter protein, CorA-like  36.56 
 
 		 327 aa  225  8e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4137  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.3 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  hitchhiker  0.000000000148264 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2830  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  37.27 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0018  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.39 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000124809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.83 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000270616  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3715  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.38 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000111951  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0790  Mg2+ transporter  35.38 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000404579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3656  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.83 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000861188  hitchhiker  0.00000222917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0125  magnesium transporter, putative  38.36 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0644  magnesium transporter, putative  37.12 
 
 		 321 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0681  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  35.38 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0655  Mg2 transporter protein, CorA family protein  35.58 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194891  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2647  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  36.25 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3984  magnesium transporter, putative  37.76 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0654  Mg2 transporter protein, CorA family protein  34.97 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000466682  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3367  Mg2 transporter protein, CorA family protein  35.38 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00335371  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2621  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  36.3 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.533199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0618  Mg2 transporter protein, CorA family protein  33.68 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41630  putative cytoplasmic membrane-associated protein  38.1 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2609  zinc transporter  33.22 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.590272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3533  hypothetical protein  37.76 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2390  zinc transporter  33.56 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1907  zinc transporter  33.56 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.250715  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1799  zinc transporter  33.56 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2908  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  33.02 
 
 		 321 aa  173  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000151397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2530  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  33.44 
 
 		 326 aa  172  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2318  zinc transporter  31.12 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2600  zinc transporter  31.12 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1772  zinc transporter  31.6 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1596  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.52 
 
 		 331 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180854  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3655  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  38.03 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561597  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2085  cmaX protein  38.03 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10467  normal  0.016656 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0552  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.17 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1603  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.77 
 
 		 331 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  decreased coverage  0.000000000150807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2295  cmaX protein  36.15 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1737  zinc transporter  31.15 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01319  zinc transporter  32.08 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2302  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.08 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0640484  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1587  zinc transporter  32.08 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01329  hypothetical protein  32.08 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2283  zinc transporter  32.08 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1990  zinc transporter  32.08 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.983964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1556  zinc transporter  32.08 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1780  zinc transporter  32.08 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1459  zinc transporter  32.08 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2144  zinc transporter  31.51 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1780  zinc transporter  31.4 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0977223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1678  zinc transporter  31.4 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  0.0898182 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1840  zinc transporter  31.4 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1777  zinc transporter  31.4 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.342474  normal  0.102835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1496  zinc transporter  31.4 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0715  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.33 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3316  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.03 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1773  Mg2+ transporter protein, CorA-like  34.87 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2093  Mg2+ transporter protein, CorA-like  35.11 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1913  hypothetical protein  28.9 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2858  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  29.87 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228802  normal  0.0235683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2088  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  34.71 
 
 		 328 aa  132  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002672  Mg2+ and Co2+ transporter  27.27 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2415  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.34 
 
 		 328 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2765  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.71 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0057  Mg2+/Co2+ transporter  26.02 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1732  Mg2+ and Co2+ transporters  26.02 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1067  CorA family protein  26.02 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0361  Mg2+/Co2+ transporter  26.02 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0226  CorA family protein  26.02 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1224  Mg2+/Co2+ transporter  26.02 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297825  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1643  Mg2+/Co2+ transporter  26.02 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6749  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.13 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0748  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.85 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2904  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.69 
 
 		 370 aa  99  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407019  normal  0.898383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0462  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.33 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2617  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.33 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0488  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.33 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0396  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.33 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0423  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.33 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0549  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  27.27 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1851  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.28 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0103716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04870  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  25.69 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3578  Mg2+ transporter protein, CorA-like  27.24 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40270  putative cation transporter  26.35 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5383  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.83 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.600829 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  24.18 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3701  cation transporter, putative  23.62 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  23.81 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1774  Mg2+ transporter protein, CorA-like  23.62 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1736  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24.16 
 
 		 330 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0741818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  27.16 
 
 		 380 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4318  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.39 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  25.52 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.85 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1498  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23.57 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.75 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.44 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.43 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3618  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.42 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000031468 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2558  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.73 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.61 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5567  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.49 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>