18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3212 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3212  coagulation factor 5/8 type-like  100 
 
 		 425 aa  881    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1202  LicD family protein  25.85 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.673451  normal  0.966221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3977  hypothetical protein  25.59 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025331  normal  0.249589 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1451  methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.182574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1175  LicD family protein  32.57 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0820  hypothetical protein  29.63 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0746  LicD family protein  26.51 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4517  hypothetical protein  33.67 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2732  methyltransferase FkbM family  32.32 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0889  LicD family protein  29.93 
 
 		 373 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.207748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2462  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.98 
 
 		 820 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00583202  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2733  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.31 
 
 		 778 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  29.37 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3213  hypothetical protein  25.13 
 
 		 651 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  29.2 
 
 		 818 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1182  hypothetical protein  30.93 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.29 
 
 		 1390 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0386  fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1  30.86 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>