74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3084 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3084  flagellar protein FlaG protein  100 
 
 		 146 aa  290  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2834  flagellar protein FlaG protein  43.53 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.211869  hitchhiker  0.00811626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3702  flagellar protein FlaG protein  37.61 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.908227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50280  hypothetical protein  41.49 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  decreased coverage  0.0000840961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2366  flagellar protein FlaG protein  46.77 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0702  flagellar protein FlaG protein  39.51 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.239709 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002807  flagellin protein FlaG  40.7 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1725  flagellar protein FlaG  40.54 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4278  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03170  flagellar protein FlaG  35.16 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1491  flagellin FlaG  37.23 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3015  flagellin FlaG, putative  40.51 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4377  flagellin FlaG, putative  44.62 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2888  flagellar protein FlaG protein  40.23 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3938  flagellar protein FlaG protein  35.79 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.754994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1528  flagellar protein FlaG protein  37.14 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1591  putative flagellar protein FlaG  46.97 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1985  flagellar protein FlaG protein  46.03 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2199  bacitracin resistance protein BacA  43.08 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0463  flagellar protein FlaG protein  45.45 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3074  flagellar protein FlaG protein  40 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1490  flagellar protein FlaG protein  40.62 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1316  flagellar protein FlaG protein  47.27 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3465  flagellar protein FlaG protein  46.3 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2584  flagellar protein FlaG protein  36.36 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1353  flagellar protein FlaG protein  42.19 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417115  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1174  flagellar protein FlaG protein  44.64 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000565064  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2944  flagellar protein FlaG protein  39.19 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3076  flagellar protein FlaG protein  39.19 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409729  normal  0.440687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1980  flagellar protein FlaG protein  35.51 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1358  flagellar protein FlaG protein  45.45 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1449  flagellar protein FlaG protein  37.5 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.797561  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1950  flagellin FlaG, putative  33.02 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1610  flagellar protein FlaG protein  38.46 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0783  flagellar protein FlaG protein  40 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2934  flagellar protein FlaG protein  35.58 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1334  flagellar protein FlaG protein  43.64 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.427646  normal  0.0470122 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1782  flagellar protein FlaG protein  35.9 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.815538  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2591  flagellar protein FlaG protein  38.89 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3236  flagellin FlaG  40.32 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0701  flagellar protein FlaG protein  35.94 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.292415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0668  flagellar protein FlaG protein  29.29 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.032129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0505  flagellar protein FlaG protein  36.36 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.86441  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0083  flagellar protein FlaG protein  52.27 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2305  uncharacterized flagellar protein FlaG  52.17 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1429  flagellar protein FlaG protein  41.82 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3569  flagellar protein FlaG protein  30.84 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1274  flagellar protein FlaG protein  32.53 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1499  flagellar protein FlaG protein  40.35 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0104  flagellar protein FlaG protein  30.09 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5090  flagellar protein FlaG protein  31.93 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5253  flagellar protein FlaG  31.58 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0373226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1342  flagellar protein FlaG protein  36.71 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27850  Flagellar protein  28.83 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0233  hypothetical protein  31.33 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000522859  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1338  flagellar protein FlaG protein  45.45 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02915  FlaG  32.39 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0190193  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0632  flagellar protein FlaG protein  28.57 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000438476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2219  flagellar protein FlaG protein  37.29 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2413  flagellar protein FlaG protein  29.85 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1473  flagellin FlaG, putative  30.67 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0093  flagellar protein FlaG  28.05 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17070  flagellar protein FlaG protein  31.65 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1993  flagellar protein FlaG protein  37.31 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.434573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1113  uncharacterized flagellar protein FlaG  37.7 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0764  flagellar protein FlaG protein  30.77 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1654  flagellar protein FlaG protein  32.86 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0401  flagellar protein FlaG protein  39.02 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1450  hypothetical protein  32.88 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000269237  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1451  flagellar protein FlaG protein  38.33 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1383  flagellar protein FlaG  26.25 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0572  flagellar protein FlaG  26.25 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0651  flagellar protein FlaG  26.25 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.470615  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0993  flagellar protein FlaG protein  31.08 
 
 		 134 aa  40  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.927319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>