22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2747 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  569  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  44.4 
 
 		 276 aa  235  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  29.53 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4132  hypothetical protein  22.37 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  26.91 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  25.26 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  24.15 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  23.59 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2026  hypothetical protein  23.3 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.958277  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  23.72 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  27.32 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1726  hypothetical protein  28.1 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978889 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4416  hypothetical protein  28.1 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  26.02 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3714  hypothetical protein  26.39 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  29.14 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  21.6 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2017  hypothetical protein  22.36 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.02732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1980  hypothetical protein  22.4 
 
 		 507 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2456  hypothetical protein  23.57 
 
 		 199 aa  42  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>