More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2255 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  100 
 
 
331 aa  692    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  57.66 
 
 
330 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  57.66 
 
 
330 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  55.76 
 
 
328 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  55.76 
 
 
340 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  56.5 
 
 
331 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  55.83 
 
 
328 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  55.62 
 
 
335 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  55.56 
 
 
330 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  54.1 
 
 
328 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  57.32 
 
 
317 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  54.29 
 
 
328 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  58.31 
 
 
332 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  53.96 
 
 
330 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  54.41 
 
 
327 aa  363  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  54.08 
 
 
328 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  55.94 
 
 
449 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  52.76 
 
 
331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  52.76 
 
 
331 aa  355  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  56.33 
 
 
329 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  57.05 
 
 
491 aa  354  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  53.99 
 
 
328 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  53.78 
 
 
326 aa  351  8.999999999999999e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  55.3 
 
 
324 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  53.68 
 
 
328 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  55.72 
 
 
329 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  52.58 
 
 
331 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  53.56 
 
 
324 aa  348  5e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  55.15 
 
 
328 aa  347  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  57.14 
 
 
328 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  53.17 
 
 
330 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  52.57 
 
 
331 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  53.64 
 
 
329 aa  344  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  52.76 
 
 
331 aa  342  5e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  51.52 
 
 
328 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  54.01 
 
 
329 aa  341  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  51.51 
 
 
331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  50.61 
 
 
326 aa  335  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  50.9 
 
 
331 aa  335  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  53.19 
 
 
334 aa  333  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  51.67 
 
 
330 aa  332  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  50.47 
 
 
320 aa  326  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  49.54 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  50.3 
 
 
331 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  53.62 
 
 
325 aa  325  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  55.63 
 
 
324 aa  325  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  52.16 
 
 
338 aa  324  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  48.8 
 
 
331 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  50 
 
 
333 aa  322  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  51.27 
 
 
334 aa  322  6e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  50 
 
 
328 aa  322  6e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  49.23 
 
 
328 aa  321  8e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  49.09 
 
 
332 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  49.1 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  50.75 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  48.05 
 
 
331 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
330 aa  318  6e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  48.49 
 
 
328 aa  316  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  46.91 
 
 
327 aa  315  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  49.38 
 
 
329 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
327 aa  315  8e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  52.53 
 
 
330 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  51.5 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  49.09 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  48.79 
 
 
335 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.39 
 
 
329 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  48.32 
 
 
331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  48.94 
 
 
328 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  47.59 
 
 
329 aa  311  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  49.08 
 
 
342 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  49.09 
 
 
327 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
360 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  52.52 
 
 
328 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  47.01 
 
 
329 aa  309  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  47.83 
 
 
329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  48.47 
 
 
328 aa  306  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  46.67 
 
 
334 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  47.76 
 
 
327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  49.54 
 
 
331 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  49.69 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  44.98 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  47.52 
 
 
327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  50 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  46.25 
 
 
331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  50.32 
 
 
309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  47.89 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  48.15 
 
 
331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  51.52 
 
 
325 aa  302  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  50.9 
 
 
327 aa  302  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  49.04 
 
 
320 aa  301  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  45.96 
 
 
327 aa  302  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  46.53 
 
 
331 aa  301  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  45.99 
 
 
327 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4943  aldo/keto reductase  48.31 
 
 
333 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020989  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  46.36 
 
 
334 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.36 
 
 
334 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  45.78 
 
 
329 aa  299  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  48.6 
 
 
327 aa  298  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  46.73 
 
 
336 aa  298  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  50.68 
 
 
325 aa  295  5e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>