24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0156 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  100 
 
 		 150 aa  316  7e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  45.95 
 
 		 157 aa  99.4  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  40.94 
 
 		 149 aa  95.9  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  36.8 
 
 		 161 aa  93.6  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  38.14 
 
 		 178 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  32.39 
 
 		 182 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  38.39 
 
 		 178 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  38.39 
 
 		 178 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 183 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  33.09 
 
 		 182 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  36.61 
 
 		 181 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  41.35 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  37.38 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  35.66 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  33.62 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  35.11 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  32.43 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  32.26 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  29.73 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  25.83 
 
 		 232 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  28.47 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  29.51 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>