34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1897 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1897  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 		 878 aa  1786    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0975  oligopeptide binding protein, putative  78.74 
 
 		 867 aa  1404    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.200479 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1418  cell wall anchor domain-containing protein  79.98 
 
 		 863 aa  1434    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.939763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0913  cell wall anchor domain-containing protein  81.64 
 
 		 868 aa  1425    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.694923 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0618  solute binding protein-like protein  31.12 
 
 		 820 aa  371  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0800  solute binding protein-like protein  28.81 
 
 		 919 aa  265  3e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0149  solute binding protein-like protein  29.04 
 
 		 895 aa  224  4e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.450727  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2228  conserved hypothetical protein  26.26 
 
 		 903 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1065  oligopeptide binding protein, putative  28.72 
 
 		 701 aa  207  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000159871  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1074  solute binding protein-like protein  28.75 
 
 		 843 aa  203  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.297086  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1072  putative lipoprotein  26.47 
 
 		 871 aa  201  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000214841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0396  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 		 868 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2180  solute binding protein-like protein  27.8 
 
 		 862 aa  196  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521964  normal  0.207273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13080  lipoprotein, putative  28.04 
 
 		 612 aa  180  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.05 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  37.01 
 
 		 524 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 607 aa  55.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13090  lipoprotein, putative  34.38 
 
 		 198 aa  54.7  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 544 aa  53.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 606 aa  53.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 538 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 490 aa  52.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 		 1437 aa  50.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1971  extracellular solute-binding protein family 5  29.13 
 
 		 525 aa  50.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.743088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 531 aa  50.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 		 580 aa  49.3  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 556 aa  48.9  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 535 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 		 509 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 		 508 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  21.35 
 
 		 551 aa  46.2  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.07 
 
 		 532 aa  45.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  22.22 
 
 		 509 aa  45.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 528 aa  44.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>