16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1089 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1089  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 127 aa  263  8e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.947057 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  58.06 
 
 		 127 aa  163  9e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1347  DNA polymerase beta subunit  43.7 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.103374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1502  DNA polymerase beta subunit  39.09 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000371654 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0821  DNA polymerase beta subunit  37.01 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.29047 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0587  DNA polymerase beta subunit  41.41 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.838533 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1320  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.475196  normal  0.327189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.92 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  27.78 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  31.63 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1691  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000100624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  60.53 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  51.35 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3539  DNA polymerase, beta-like region  57.58 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418484  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  58.82 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  56.76 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>