23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1028 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 94 aa  185  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  44.71 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  46.91 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  45.07 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  56.9 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  39.24 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  35.16 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1132  DNA polymerase beta subunit  40.28 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3922  DNA polymerase beta subunit  44.07 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0657046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3091  DNA polymerase, beta-like region  35.29 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1450  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  43.02 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  34.15 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0855  DNA polymerase beta subunit  43.08 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.725816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  37.35 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0856  DNA polymerase beta subunit  42.11 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.917822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2214  hypothetical protein  68 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0275892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2191  DNA polymerase beta subunit  32.95 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190588  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  41.38 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  33.72 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  57.14 
 
 		 110 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2455  DNA polymerase beta domain protein region  39.66 
 
 		 110 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.347866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>