20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1738 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  100 
 
 		 130 aa  253  4e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  39.84 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1169  PilT domain-containing protein  40.31 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0930  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0450  hypothetical protein  38.4 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0090  hypothetical protein  46.59 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  28.78 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  25.56 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  31.06 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  26.5 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  32.41 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1020  PilT protein domain protein  25.83 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  25.22 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  25.64 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  32.18 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0676  PilT protein domain protein  29.91 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  29.82 
 
 		 142 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  28.8 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>