29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02272 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00511  TAL effector AvrBs3/PthA  92.63 
 
 		 623 aa  1115    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0108492  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05633  TAL effector AvrBs3/PthA  92.42 
 
 		 904 aa  1571    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00212942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05609  TAL effector AvrBs3/PthA  91.78 
 
 		 1017 aa  1736    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03922  TAL effector AvrBs3/PthA  86.91 
 
 		 1037 aa  1789    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02272  TAL effector AvrBs3/PthA  100 
 
 		 1107 aa  2184    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02269  TAL effector AvrBs3/PthA  94.12 
 
 		 734 aa  1294    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.046405  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02172  TAL effector AvrBs3/PthA  84.76 
 
 		 1086 aa  1691    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01085  TAL effector AvrBs3/PthA  90.76 
 
 		 983 aa  1685    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000275966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00572  TAL effector AvrBs3/PthA  91.9 
 
 		 1047 aa  1824    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00567  TAL effector AvrBs3/PthA  92.85 
 
 		 810 aa  1442    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109196  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00546  TAL effector AvrBs3/PthA  91.39 
 
 		 969 aa  1649    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00505  TAL effector AvrBs3/PthA  89.47 
 
 		 653 aa  1050    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.467766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00318  TAL effector AvrBs3/PthA  93.09 
 
 		 811 aa  1452    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.566935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00227  TAL effector AvrBs3/PthA  93.59 
 
 		 1267 aa  1972    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.855849  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00223  TAL effector AvrBs3/PthA  84.12 
 
 		 1068 aa  1381    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05714  TAL effector AvrBs3/PthA  88.93 
 
 		 1483 aa  1886    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0599163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05718  TAL effector AvrBs3/PthA  91.65 
 
 		 868 aa  1478    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000318376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06229  TAL effector AvrBs3/PthA  92.42 
 
 		 904 aa  1571    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00614737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06234  TAL effector AvrBs3/PthA  90.76 
 
 		 983 aa  1685    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00915225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1815  hypothetical protein  45.15 
 
 		 1245 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 1276 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 		 1371 aa  67  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  27.55 
 
 		 1809 aa  59.3  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.34 
 
 		 1838 aa  58.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  21.22 
 
 		 1676 aa  57  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.55 
 
 		 1022 aa  55.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  19.72 
 
 		 1534 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4068  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  27.73 
 
 		 1561 aa  47.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.516852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.28 
 
 		 1343 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>