30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02053 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  98.55 
 
 		 920 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  98.55 
 
 		 920 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02053  putative VGR-related protein  100 
 
 		 69 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.483238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02060  Rhs element Vgr protein  92.11 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  53.97 
 
 		 927 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  52.38 
 
 		 947 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  50.79 
 
 		 942 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  47.62 
 
 		 946 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  47.62 
 
 		 946 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  47.62 
 
 		 946 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  54.24 
 
 		 918 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  46.67 
 
 		 895 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  45.28 
 
 		 741 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  46.67 
 
 		 895 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  46.67 
 
 		 895 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  45.28 
 
 		 689 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  46.67 
 
 		 895 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  45 
 
 		 891 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  43.4 
 
 		 741 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  43.4 
 
 		 643 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  45.28 
 
 		 689 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  37.74 
 
 		 683 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  39.62 
 
 		 683 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  44.26 
 
 		 933 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  36.92 
 
 		 1063 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  38.1 
 
 		 890 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  41.51 
 
 		 646 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  36.92 
 
 		 1057 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  50 
 
 		 928 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  35.38 
 
 		 1074 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>