62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5538 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5538  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  100 
 
 		 451 aa  900    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0008  dual specificity protein phosphatase  63.91 
 
 		 445 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.851139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  64.97 
 
 		 449 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31730  hypothetical protein  64.85 
 
 		 437 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00205255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3658  putative dual specificity phosphatase  59.9 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4660  Dual specificity protein phosphatase  49.64 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2884  Dual specificity protein phosphatase  44.63 
 
 		 437 aa  355  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.170107  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  45.37 
 
 		 464 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2877  putative phosphatase protein  45.73 
 
 		 447 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510949  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  43.15 
 
 		 467 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  43.31 
 
 		 471 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3002  PAP2 family phosphatase  43.32 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3080  putative dual specificity phosphatase  43.32 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  42.82 
 
 		 468 aa  300  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1291  PAP2 family phosphatase  43.09 
 
 		 439 aa  298  9e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  42.86 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  42.86 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  43.49 
 
 		 428 aa  292  9e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1172  Dual specificity phosphatase catalytic subunit  42.72 
 
 		 428 aa  292  9e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0267685  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  42.73 
 
 		 467 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  38.61 
 
 		 430 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  38.94 
 
 		 430 aa  266  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  38.7 
 
 		 430 aa  266  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  38.7 
 
 		 430 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  38.7 
 
 		 430 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  38.7 
 
 		 430 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  38.85 
 
 		 438 aa  263  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  38.85 
 
 		 430 aa  262  8e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  38.46 
 
 		 438 aa  262  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.88 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02972  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  64.46 
 
 		 132 aa  159  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  34.27 
 
 		 246 aa  91.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  33 
 
 		 540 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3589  putative PAP2 family protein  30.05 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000468424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5133  PAP2 family protein  28.64 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000713606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4706  PAP2 family protein  28.64 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0195137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5104  PAP2 family protein  28.64 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  28.17 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  28.48 
 
 		 581 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5138  PAP2 family protein  30.22 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000319321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5238  PAP2 family protein  30.05 
 
 		 215 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.108629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  25.41 
 
 		 563 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4866  PAP2 family protein  30.05 
 
 		 215 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  25.41 
 
 		 563 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  27.39 
 
 		 545 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4721  PAP2 family protein  27.7 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00298694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5140  PAP2 family protein  27.7 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000194372  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  25.41 
 
 		 563 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0102  PAP2 family protein  28.96 
 
 		 215 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000373231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  25.41 
 
 		 568 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  27.11 
 
 		 552 aa  53.9  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.11 
 
 		 217 aa  53.5  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4824  PAP2 family protein  30.43 
 
 		 215 aa  53.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00045347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.57 
 
 		 202 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.41 
 
 		 217 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  24.44 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  24.59 
 
 		 560 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2121  Ser/Thr and Tyr protein phosphatase (dual specificity)#  27.69 
 
 		 240 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000187459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1848  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.05 
 
 		 238 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2865  hypothetical protein  34.26 
 
 		 206 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.423571 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2878  hypothetical protein  21.74 
 
 		 230 aa  43.5  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.259578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  24.07 
 
 		 565 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>