48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4401 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  94.04 
 
 		 161 aa  290  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4429  hypothetical protein  78.67 
 
 		 151 aa  213  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  68 
 
 		 151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  67.55 
 
 		 209 aa  206  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  67.55 
 
 		 209 aa  206  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  67.33 
 
 		 151 aa  203  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0929  hypothetical protein  72.3 
 
 		 151 aa  197  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.674823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4977  hypothetical protein  60.93 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.204636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57250  hypothetical protein  62.5 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2183  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000427964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2028  hypothetical protein  35.82 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2638  hypothetical protein  29.55 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0193906  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0361  hypothetical protein  31.94 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000115827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4527  hypothetical protein  31.03 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000460771  unclonable  0.0000000198081 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3773  protein of unknown function DUF721  32.17 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  28.23 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2445  hypothetical protein  31.01 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000170869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0416  hypothetical protein  30.61 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000379477  hitchhiker  0.000470097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  28.77 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3798  hypothetical protein  32.52 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000270613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  28.77 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3805  hypothetical protein  31.51 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3585  hypothetical protein  31.47 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0617  protein of unknown function DUF721  30.2 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000209759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  32.71 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3511  hypothetical protein  32.67 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000118772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2911  hypothetical protein  32.67 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000130848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3380  hypothetical protein  32.67 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000736191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3447  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000038127  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0493  hypothetical protein  31.96 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000306627  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0360  hypothetical protein  31.87 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000215067  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0655  protein of unknown function DUF721  37.08 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4213  hypothetical protein  30.93 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0768  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000709717  normal  0.343025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3737  hypothetical protein  31.96 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000147329  hitchhiker  0.000000022613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  30.85 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2853  hypothetical protein  30.95 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0179123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0419  hypothetical protein  30.93 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000551607  unclonable  0.00000388194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0407  hypothetical protein  30.93 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171569  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0408  hypothetical protein  30.93 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0433  protein of unknown function DUF721  30.93 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000320142  unclonable  0.00000000000179401 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  28.97 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0392  hypothetical protein  31.96 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0777  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.080705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3490  hypothetical protein  28.69 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699802  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2193  hypothetical protein  34.71 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00409116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  28 
 
 		 219 aa  40.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>