42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0929 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0929  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  303  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.674823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  73.29 
 
 		 153 aa  215  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  71.62 
 
 		 161 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  66.22 
 
 		 151 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  63.51 
 
 		 151 aa  193  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  63.51 
 
 		 209 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  63.51 
 
 		 209 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4429  hypothetical protein  70.95 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4977  hypothetical protein  68 
 
 		 153 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.204636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57250  hypothetical protein  68.5 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2183  hypothetical protein  35.25 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000427964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0361  hypothetical protein  32.62 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000115827  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2028  hypothetical protein  31.11 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2445  hypothetical protein  32.03 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000170869  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0360  hypothetical protein  33.05 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000215067  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4527  hypothetical protein  30.5 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000460771  unclonable  0.0000000198081 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2638  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0193906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2487  hypothetical protein  27.64 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000990571  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3447  hypothetical protein  32.23 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000038127  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0408  hypothetical protein  34.38 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0433  protein of unknown function DUF721  34.38 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000320142  unclonable  0.00000000000179401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0407  hypothetical protein  34.38 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0416  hypothetical protein  31.21 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000379477  hitchhiker  0.000470097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0419  hypothetical protein  34.38 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000551607  unclonable  0.00000388194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3805  hypothetical protein  31.69 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0617  protein of unknown function DUF721  33.73 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000209759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000306627  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000147329  hitchhiker  0.000000022613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4213  hypothetical protein  32.29 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2853  hypothetical protein  31.88 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0179123  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3798  hypothetical protein  32.88 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000270613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0768  hypothetical protein  31.69 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000709717  normal  0.343025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0655  protein of unknown function DUF721  32.22 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3773  protein of unknown function DUF721  30.5 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2911  hypothetical protein  34.44 
 
 		 174 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000130848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3511  hypothetical protein  34.44 
 
 		 174 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000118772  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3380  hypothetical protein  34.44 
 
 		 174 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000736191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3585  hypothetical protein  29.08 
 
 		 175 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  27.46 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  28.17 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0516  hypothetical protein  26.28 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>