37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_57250 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_57250  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4977  hypothetical protein  96.95 
 
 		 153 aa  203  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.204636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  62.5 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  62.5 
 
 		 161 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  61.9 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0929  hypothetical protein  68.5 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.674823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  58.73 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  58.73 
 
 		 209 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  58.73 
 
 		 209 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4429  hypothetical protein  60.8 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2183  hypothetical protein  35.83 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000427964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2028  hypothetical protein  40.23 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3773  protein of unknown function DUF721  32.84 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2638  hypothetical protein  27.61 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0193906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0617  protein of unknown function DUF721  30.6 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000209759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004484  hypothetical protein  30.47 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000519516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3585  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0655  protein of unknown function DUF721  31.69 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0361  hypothetical protein  38.83 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000115827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3447  hypothetical protein  33.02 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000038127  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1154  hypothetical protein  28.24 
 
 		 154 aa  43.9  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00206415  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3380  hypothetical protein  32.03 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000736191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0768  hypothetical protein  31.58 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000709717  normal  0.343025 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2911  hypothetical protein  32.03 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000130848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3511  hypothetical protein  32.03 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000118772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4527  hypothetical protein  33.02 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000460771  unclonable  0.0000000198081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0416  hypothetical protein  33.01 
 
 		 150 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000379477  hitchhiker  0.000470097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2445  hypothetical protein  35.79 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000170869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2525  hypothetical protein  32.65 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2655  hypothetical protein  32.65 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00908  hypothetical protein  28.79 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2853  hypothetical protein  29.81 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0179123  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0408  hypothetical protein  36.27 
 
 		 148 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0433  protein of unknown function DUF721  36.27 
 
 		 148 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000320142  unclonable  0.00000000000179401 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0419  hypothetical protein  36.27 
 
 		 148 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000551607  unclonable  0.00000388194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0407  hypothetical protein  36.27 
 
 		 148 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171569  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0516  hypothetical protein  29.85 
 
 		 173 aa  40  0.01  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>