43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3447 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3447  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000038127  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4527  hypothetical protein  84.67 
 
 
150 aa  256  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000460771  unclonable  0.0000000198081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3805  hypothetical protein  84 
 
 
150 aa  255  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310465  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0416  hypothetical protein  81.33 
 
 
150 aa  244  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000379477  hitchhiker  0.000470097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0407  hypothetical protein  75.68 
 
 
148 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0433  protein of unknown function DUF721  75.68 
 
 
148 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000320142  unclonable  0.00000000000179401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3737  hypothetical protein  75.68 
 
 
148 aa  217  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000147329  hitchhiker  0.000000022613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0419  hypothetical protein  75.68 
 
 
148 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000551607  unclonable  0.00000388194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0408  hypothetical protein  75.68 
 
 
148 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0493  hypothetical protein  76.35 
 
 
148 aa  216  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000306627  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0392  hypothetical protein  75 
 
 
148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0361  hypothetical protein  70 
 
 
150 aa  214  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000115827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4213  hypothetical protein  73.65 
 
 
148 aa  209  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0360  hypothetical protein  73.33 
 
 
150 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000215067  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3798  hypothetical protein  70 
 
 
150 aa  193  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000270613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2638  hypothetical protein  34.72 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0193906  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3585  hypothetical protein  32.88 
 
 
175 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0768  hypothetical protein  34.48 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000709717  normal  0.343025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3773  protein of unknown function DUF721  33.57 
 
 
175 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2911  hypothetical protein  32.41 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000130848  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3511  hypothetical protein  32.41 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000118772  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3380  hypothetical protein  32.41 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000736191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0617  protein of unknown function DUF721  34.59 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000209759  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0655  protein of unknown function DUF721  31.47 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004484  hypothetical protein  27.01 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000519516  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0516  hypothetical protein  30.34 
 
 
173 aa  67  0.00000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00908  hypothetical protein  27.74 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1973  hypothetical protein  29.5 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2000  protein of unknown function DUF721  31.58 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372518  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4456  hypothetical protein  26.54 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  33.79 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  33.57 
 
 
209 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  33.57 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  33.57 
 
 
209 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2183  hypothetical protein  29.14 
 
 
156 aa  47  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000427964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  30.34 
 
 
161 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  31.03 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0496  hypothetical protein  27.34 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00166057  normal  0.977883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0471  hypothetical protein  27.34 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396188  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1154  hypothetical protein  29.81 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00206415  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  24.46 
 
 
180 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3653  hypothetical protein  26.62 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2853  hypothetical protein  28.12 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0179123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>