45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0439 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  80.22 
 
 		 456 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  916    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  93.29 
 
 		 462 aa  819    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  80 
 
 		 454 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  79.78 
 
 		 454 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  82 
 
 		 461 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  80.75 
 
 		 454 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  75 
 
 		 455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  73.42 
 
 		 447 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  73.66 
 
 		 459 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  73.71 
 
 		 458 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  61.47 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  58.04 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  39.18 
 
 		 464 aa  319  7e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  47.02 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  37.32 
 
 		 454 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  41.48 
 
 		 538 aa  279  9e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  41.21 
 
 		 524 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  42.57 
 
 		 520 aa  273  6e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  29.18 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  29.18 
 
 		 476 aa  96.7  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  35.56 
 
 		 508 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  25.45 
 
 		 474 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  27.43 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1439  hypothetical protein  36.53 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  22.41 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  36.71 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  36.49 
 
 		 664 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1268  GTP-binding protein Era  44.93 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0519  GTP-binding protein EngA  21.86 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  48.39 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1950  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.73 
 
 		 218 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000597271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  35.38 
 
 		 663 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  35.38 
 
 		 663 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  30.46 
 
 		 663 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  44.78 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2483  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  36.07 
 
 		 198 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.528344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  43.04 
 
 		 305 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  39.08 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  40.26 
 
 		 313 aa  43.9  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2142  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  35.38 
 
 		 209 aa  43.9  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  30.52 
 
 		 420 aa  43.9  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  32.67 
 
 		 458 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  26.36 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1813  GTP-binding protein EngA  39.34 
 
 		 436 aa  43.1  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>