27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4696 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4696  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55180  10Sa RNA SsrA (tmRNA)  100 
 
 		 352 bp  133  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0016    98.57 
 
 		 354 bp  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA65    94.03 
 
 		 392 bp  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0003    93.94 
 
 		 391 bp  99.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000332407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0098    93.94 
 
 		 398 bp  99.6  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0096    93.75 
 
 		 389 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430458  normal  0.0134001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R17    92.54 
 
 		 390 bp  93.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138375  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5663  tmRNA  92.42 
 
 		 387 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420561  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0048    87.69 
 
 		 389 bp  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4254  10Sa RNA (tmRNA)  96.97 
 
 		 364 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000812239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0012    96.97 
 
 		 384 bp  58  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0012    96.97 
 
 		 359 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4223    96.97 
 
 		 364 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140145  normal  0.0140433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0081    96.88 
 
 		 380 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.124848  normal  0.269068 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0009    96.88 
 
 		 366 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0025    96.88 
 
 		 362 bp  56  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0024    96.88 
 
 		 362 bp  56  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0041    96.77 
 
 		 384 bp  54  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00705432  hitchhiker  0.00312299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0019    96.77 
 
 		 384 bp  54  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  unclonable  0.0000024281 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0026    90.7 
 
 		 361 bp  54  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.918941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0069    96.67 
 
 		 360 bp  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.217492 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3178s    96.67 
 
 		 364 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0373  10Sa RNA (tmRNA)  93.94 
 
 		 367 bp  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0007    93.75 
 
 		 356 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000338261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0074    93.75 
 
 		 358 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312491  normal  0.744934 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0007    93.33 
 
 		 354 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>