33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3838 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1108    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  97.1 
 
 		 551 aa  1055    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  33.75 
 
 		 558 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  33.21 
 
 		 550 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  34.77 
 
 		 552 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  32.42 
 
 		 545 aa  259  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  30.94 
 
 		 552 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  30.24 
 
 		 551 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  30.98 
 
 		 548 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  32.1 
 
 		 578 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  29.48 
 
 		 551 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  26.69 
 
 		 538 aa  189  9e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  30.89 
 
 		 550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  27.92 
 
 		 545 aa  140  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  25.78 
 
 		 547 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  27.08 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  26.58 
 
 		 586 aa  121  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1973  hypothetical protein  26.16 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  25.05 
 
 		 509 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  22.12 
 
 		 509 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  22.56 
 
 		 624 aa  85.9  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  25.19 
 
 		 517 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  22.38 
 
 		 521 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  22.13 
 
 		 555 aa  78.6  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  22.8 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  26.7 
 
 		 788 aa  70.5  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2775 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1378  hypothetical protein  24.55 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  27.14 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  22.83 
 
 		 591 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0802  hypothetical protein  28.21 
 
 		 473 aa  53.5  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00695722  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  22.3 
 
 		 536 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0829  hypothetical protein  23.91 
 
 		 461 aa  45.4  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000679241  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2671  hypothetical protein  25.32 
 
 		 649 aa  45.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0148077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>