More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1970 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
326 aa  680    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.67 
 
 
326 aa  558  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.46 
 
 
326 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.46 
 
 
326 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1237  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  73.43 
 
 
335 aa  535  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000110601  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.46 
 
 
334 aa  526  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.38 
 
 
333 aa  503  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.34 
 
 
326 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.93 
 
 
336 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.95 
 
 
332 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.63 
 
 
336 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.04 
 
 
323 aa  424  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  60.12 
 
 
323 aa  421  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.09 
 
 
335 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.19 
 
 
334 aa  401  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.06 
 
 
323 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  56.8 
 
 
333 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01131  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  56.4 
 
 
335 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.434009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.84 
 
 
326 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  51.96 
 
 
335 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.87 
 
 
334 aa  360  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.6 
 
 
330 aa  358  5e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.85 
 
 
328 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.54 
 
 
336 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.6 
 
 
327 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.76 
 
 
328 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.64 
 
 
335 aa  305  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
328 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
313 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
345 aa  176  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
328 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.03 
 
 
330 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
314 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.6 
 
 
313 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 
312 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  36.14 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.51 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.33 
 
 
331 aa  162  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 
325 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  34.39 
 
 
326 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.6 
 
 
323 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.71 
 
 
323 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.45 
 
 
318 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
329 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.18 
 
 
336 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
326 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.18 
 
 
336 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.42 
 
 
322 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.11 
 
 
322 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
322 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.8 
 
 
322 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.85 
 
 
318 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0415  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.44 
 
 
324 aa  156  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.021137  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.19 
 
 
357 aa  155  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.96 
 
 
336 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.89 
 
 
322 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.19 
 
 
322 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.54 
 
 
330 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 
324 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.75 
 
 
308 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.45 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 
343 aa  153  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.89 
 
 
322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.89 
 
 
322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.17 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.23 
 
 
334 aa  151  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.91 
 
 
310 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
322 aa  151  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000493434  normal  0.801041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.37 
 
 
336 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
333 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.44 
 
 
327 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.92 
 
 
323 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  30.91 
 
 
308 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.95 
 
 
307 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 
329 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
310 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
319 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.84 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.62 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  32.92 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.8 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.28 
 
 
321 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  35.08 
 
 
321 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.28 
 
 
321 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  32.8 
 
 
345 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.28 
 
 
321 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.58 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.94 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.11 
 
 
330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.89 
 
 
321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3742  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.28 
 
 
321 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.22 
 
 
329 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>