52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1351 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1351  aromatic amino acid transporter  100 
 
 		 418 aa  835    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15700  putative amino acid permease  97.37 
 
 		 418 aa  820    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.328993  hitchhiker  0.00000000000353656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4304  aromatic amino acid permease  70.48 
 
 		 414 aa  568  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39750  putative amino acid permease  58.31 
 
 		 410 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0459  Amino acid transporter transmembrane  25.62 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0692  hypothetical protein  25.4 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0710  hypothetical protein  25.13 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  26.26 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  26.26 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  26.26 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  26.26 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  26.26 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  24.78 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  26.85 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36976  predicted protein  24.46 
 
 		 511 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0204  Mtr/TnaB/TyrO permease family protein  24.02 
 
 		 398 aa  53.5  0.000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  25.81 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  26.85 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  26.85 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  26.85 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  26.85 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  26.85 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  26.85 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47852  HAAAP family transporter: tyrosine  28.25 
 
 		 534 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.00117106 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  25.41 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  26.58 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  26.58 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  23.39 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  23.39 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  23.39 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42458  HAAAP family transporter: tyrosine  25.61 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166063  normal  0.266354 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  24.85 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  24.13 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  24.18 
 
 		 418 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0800  tryptophan permease  25.37 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.121788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  23.65 
 
 		 467 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  22.85 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  24.12 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0709  hypothetical protein  22.73 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0691  hypothetical protein  22.73 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10137  HAAAP family transporter: tyrosine/tryptophan  24.93 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000465151  normal  0.0223874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  23.88 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  23.91 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  24.82 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  24.73 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0448  tyrosine-specific transport protein  21.56 
 
 		 426 aa  44.3  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1723  tryptophan/tyrosine permease family protein  21.56 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  26.63 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  26.63 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  23.36 
 
 		 416 aa  43.5  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  23.9 
 
 		 388 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  26.13 
 
 		 400 aa  43.1  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>