118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42458 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_42458  HAAAP family transporter: tyrosine  100 
 
 
408 aa  810    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166063  normal  0.266354 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36976  predicted protein  30.16 
 
 
511 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10137  HAAAP family transporter: tyrosine/tryptophan  27.65 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000465151  normal  0.0223874 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47852  HAAAP family transporter: tyrosine  29.69 
 
 
534 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  unclonable  0.00117106 
 
 
-
 
NC_002620  TC0205  Mtr/TnaB/TyrO permease family protein  24.71 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.702392  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0204  Mtr/TnaB/TyrO permease family protein  24.3 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  26.13 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  28.82 
 
 
388 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0709  hypothetical protein  26.82 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0691  hypothetical protein  26.82 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  25.81 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  25.94 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  25.92 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  25.92 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  25.92 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  25.92 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  26.1 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  25.63 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  27.22 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1723  tryptophan/tyrosine permease family protein  25.14 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0448  tyrosine-specific transport protein  25.14 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  24.93 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  25.34 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  24.59 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  25.82 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  25.82 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  25.51 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  25.82 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  25.82 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  25.82 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  25.82 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  25.82 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  25.82 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  25.57 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  25.32 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  25.98 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  25.57 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0710  hypothetical protein  23.96 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  24.08 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  25.5 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  24.54 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  24.93 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  24.55 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0692  hypothetical protein  23.68 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  24.53 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  25.06 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  25.13 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  22.7 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  24.22 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  25.06 
 
 
418 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  25.2 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  25.14 
 
 
395 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  25.14 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  25.57 
 
 
414 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1074  tyrosine-specific transport protein, putative  26.6 
 
 
395 aa  63.2  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  24.46 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  25.57 
 
 
414 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  29.02 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  25.06 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  25.82 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0912  aromatic amino acid permease  25.41 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.231999  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  24.81 
 
 
418 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0948  aromatic amino acid permease  25.41 
 
 
391 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  25.59 
 
 
395 aa  60.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  24.8 
 
 
391 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  24.81 
 
 
418 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  24.8 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  24.32 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  23.77 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  24.56 
 
 
418 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3026  aromatic amino acid permease  25.14 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  25.82 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  24.46 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  24.54 
 
 
391 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  24.3 
 
 
418 aa  57.4  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  24.93 
 
 
402 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  25.32 
 
 
412 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  23.6 
 
 
418 aa  57  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  24.37 
 
 
402 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  24.37 
 
 
402 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  24.37 
 
 
402 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  24.86 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  24.54 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  27.93 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  23.1 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  23.59 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  24.93 
 
 
418 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  24.43 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  23 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45852  predicted protein  23.76 
 
 
536 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0205914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  23 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  23 
 
 
415 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  24.06 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  21.57 
 
 
417 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  24.06 
 
 
414 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  24.06 
 
 
414 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  24.06 
 
 
414 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  24.06 
 
 
414 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  24.06 
 
 
414 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  22.74 
 
 
415 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>