18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1310 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  872    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  95.44 
 
 
439 aa  834    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  51.74 
 
 
443 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  51.77 
 
 
437 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  46.88 
 
 
424 aa  350  4e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  46.91 
 
 
425 aa  333  4e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  31.96 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13971  hypothetical protein  30.19 
 
 
422 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  29.62 
 
 
444 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  31.64 
 
 
438 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  28.51 
 
 
444 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  31.2 
 
 
442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  27.34 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  27.17 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  33.48 
 
 
480 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  29.01 
 
 
435 aa  94  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  26.76 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  32.61 
 
 
434 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>