More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0140 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  100 
 
 
353 aa  736    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  98.87 
 
 
353 aa  732    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  69.97 
 
 
357 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  66.95 
 
 
352 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  61.47 
 
 
363 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  60.91 
 
 
357 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  58.12 
 
 
351 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  57.55 
 
 
351 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  58.12 
 
 
351 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  56.13 
 
 
351 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  54.67 
 
 
351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  50.29 
 
 
363 aa  394  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  51.72 
 
 
351 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  51.29 
 
 
362 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  47.74 
 
 
363 aa  362  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  36.99 
 
 
365 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  39.93 
 
 
317 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  34.94 
 
 
363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  41 
 
 
239 aa  176  6e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
286 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.19 
 
 
299 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
263 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
283 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
305 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
305 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  27.35 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  29.6 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  26.19 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  38.18 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4009  type 11 methyltransferase  27.68 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4441  methyltransferase type 11  25.7 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  28.9 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4431  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.184386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4369  Methyltransferase type 11  26.69 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  24.56 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  26.15 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.35 
 
 
220 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.87 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  32.47 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.61 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0872  hypothetical protein  26.4 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.11 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  26.49 
 
 
306 aa  67  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46747  predicted protein  24.17 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
271 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  29.53 
 
 
209 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3698  Methyltransferase type 11  24.19 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  37.14 
 
 
239 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
195 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  25.34 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.36 
 
 
258 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  30.36 
 
 
261 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  30.36 
 
 
261 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.36 
 
 
258 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.36 
 
 
261 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.36 
 
 
261 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 
281 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
219 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.24 
 
 
252 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 
199 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 
200 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0047  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.06 
 
 
223 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.601084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 
200 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.52 
 
 
244 aa  60.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.85 
 
 
212 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  29.24 
 
 
209 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
227 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  30.08 
 
 
244 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0381  methyltransferase type 11  28.22 
 
 
200 aa  60.1  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
210 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.33 
 
 
234 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
212 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1384  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.6 
 
 
247 aa  59.3  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44871  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_345  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.19 
 
 
200 aa  59.3  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0402  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.22 
 
 
200 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2929  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.36 
 
 
261 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00250227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
265 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.05 
 
 
282 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 
207 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1091  methyltransferase type 11  34.44 
 
 
273 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 
234 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.85 
 
 
215 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2670  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.76 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4638  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.65 
 
 
258 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0233383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 
207 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.46 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.57 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  24.55 
 
 
240 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_41  SAM dependent methyltransferase, UbiE family  28.12 
 
 
202 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000057615  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.65 
 
 
258 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2697  methyltransferase type 11  28.81 
 
 
264 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
261 aa  57.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  25 
 
 
267 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.64 
 
 
202 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 
231 aa  57  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  28.87 
 
 
252 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>