More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80821 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_80821  mitochondrial acyl carrier protein  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454049  normal  0.13999 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05704  acyl carrier protein, putative (JCVI)  39.86 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.922382  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04410  acyl carrier protein (acp), putative  46.77 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71972  mitochondrial acyl carrier protein  35.77 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42161  predicted protein  41.57 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0806882  normal  0.994618 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31440  acyl carrier protein  40.23 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.820176  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  57.69 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  56.6 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  57.69 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  55.77 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  55.77 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  47.14 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  55.77 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  55.77 
 
 		 78 aa  67  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 77 aa  67  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  63.46 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  54.1 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  59.26 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  55.17 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  50 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  55.17 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  55.17 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  55.17 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  52.54 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  56.36 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  55.56 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  47.14 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  55.77 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  56.6 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  59.62 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  44.93 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  53.45 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  42.5 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  51.67 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  55.17 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  52.73 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  52.46 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  44.93 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  56.6 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  52.63 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  52.54 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  52.46 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0174  acyl carrier protein  51.85 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  57.41 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  52.73 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  52.73 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  50 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  58.18 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  44.93 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  50 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  44.93 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  55.36 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  58.18 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  51.79 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  54.72 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  52.83 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  51.92 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  51.79 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  55.17 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  49.12 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  49.12 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  53.45 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  44.93 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  52.46 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  54.39 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  56.6 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  54.72 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  54.72 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  43.48 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  54.72 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  52.63 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  53.45 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  49.06 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  54.17 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  54.72 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>