More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78267 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_78267  3-phosphoglycerate kinase  100 
 
 
416 aa  835    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02220  phosphoglycerate kinase, putative  67.63 
 
 
454 aa  568  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01246  Phosphoglycerate kinase (EC 2.7.2.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P11977]  67.78 
 
 
421 aa  565  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3826  phosphoglycerate kinase  60.96 
 
 
420 aa  484  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.474406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  49.76 
 
 
400 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  49.76 
 
 
400 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.69 
 
 
646 aa  388  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  51.45 
 
 
405 aa  391  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  49.76 
 
 
396 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 
402 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  51.11 
 
 
401 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  49.64 
 
 
399 aa  383  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  49.28 
 
 
397 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  49.39 
 
 
402 aa  380  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  49.39 
 
 
399 aa  381  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  49.76 
 
 
403 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  50.6 
 
 
393 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  49.15 
 
 
400 aa  379  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  50.48 
 
 
394 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  50.72 
 
 
394 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.76 
 
 
650 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  50.24 
 
 
396 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.27 
 
 
655 aa  376  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  50.24 
 
 
393 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 
395 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  50.61 
 
 
393 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  49.64 
 
 
399 aa  368  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 
397 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  48.67 
 
 
397 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  48.43 
 
 
397 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  49.27 
 
 
394 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  46.88 
 
 
399 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  48.88 
 
 
401 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  47.75 
 
 
402 aa  363  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  46.88 
 
 
399 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  46.73 
 
 
397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  48.89 
 
 
401 aa  362  8e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  49.15 
 
 
394 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  48.67 
 
 
393 aa  361  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  48.33 
 
 
402 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  48.18 
 
 
394 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  48.33 
 
 
402 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 
399 aa  359  4e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  48.18 
 
 
394 aa  359  5e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1753  phosphoglycerate kinase  48.19 
 
 
399 aa  359  5e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.093261  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0638  phosphoglycerate kinase  49.52 
 
 
404 aa  359  5e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0343575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  48.18 
 
 
394 aa  359  6e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  46.91 
 
 
402 aa  359  6e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  48.18 
 
 
394 aa  359  6e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  49.88 
 
 
400 aa  358  9e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  47.93 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  47.24 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  47.94 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  47.94 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  47.56 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  49.76 
 
 
406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  48.32 
 
 
395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  47.7 
 
 
394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  50.24 
 
 
400 aa  356  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  47.85 
 
 
402 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.45 
 
 
654 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  47.58 
 
 
394 aa  353  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  47.9 
 
 
401 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  47.46 
 
 
394 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  47.29 
 
 
399 aa  353  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  47.65 
 
 
401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  47.58 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  47.58 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  47.96 
 
 
398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  45.63 
 
 
397 aa  352  7e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 
396 aa  352  7e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0616  phosphoglycerate kinase  45.54 
 
 
399 aa  351  1e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.160418 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  47.26 
 
 
402 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  46.87 
 
 
398 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  47.22 
 
 
396 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  46.97 
 
 
396 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  46.56 
 
 
441 aa  350  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl577  phosphoglycerate kinase  47.13 
 
 
404 aa  348  7e-95  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  46.42 
 
 
399 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  46.73 
 
 
396 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1324  phosphoglycerate kinase  47.45 
 
 
396 aa  347  3e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0186876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  46.52 
 
 
398 aa  346  5e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  46.94 
 
 
399 aa  346  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1617  phosphoglycerate kinase  47.42 
 
 
397 aa  345  7e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0893272  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  48.44 
 
 
398 aa  345  1e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  47.83 
 
 
395 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1428  phosphoglycerate kinase  45.41 
 
 
401 aa  344  2e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  45.87 
 
 
392 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0416  phosphoglycerate kinase  46.41 
 
 
400 aa  343  4e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  44.55 
 
 
397 aa  341  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  48.18 
 
 
397 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  46.83 
 
 
420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48983  predicted protein  47.74 
 
 
448 aa  340  4e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  44.82 
 
 
397 aa  339  5e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1248  phosphoglycerate kinase  44.17 
 
 
400 aa  339  5.9999999999999996e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00549877  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  44.96 
 
 
396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1589  phosphoglycerate kinase  45.58 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  45.99 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  43.45 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  46.1 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>