More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67803 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_67803  secondary alcohol dehydrogenase (SADH2)  100 
 
 
336 aa  691    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59150  secondary alcohol dehydrogenase (SADH1)  41.38 
 
 
353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318338  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.03 
 
 
349 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.23 
 
 
346 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
342 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
354 aa  146  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.49 
 
 
336 aa  145  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.19 
 
 
342 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  32 
 
 
344 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.12 
 
 
346 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.38 
 
 
342 aa  142  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  33.95 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.93 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.46 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 
345 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
342 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.48 
 
 
368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
345 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
350 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
345 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
345 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
345 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
345 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 
344 aa  139  7.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
347 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 
341 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2984  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.93 
 
 
336 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 
341 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
345 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.29 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.47 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1932  alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
336 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231287  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3839  alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
336 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  32.22 
 
 
348 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.36 
 
 
346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3554  alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
336 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.58 
 
 
337 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.94 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.96 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.85 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.96 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.96 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.96 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.96 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.96 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08979  Alcohol dehydrogenase 1 (EC 1.1.1.1)(Alcohol dehydrogenase I)(ADH I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08843]  31.84 
 
 
350 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  29.54 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1696  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2090  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1660  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01436  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
336 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2169  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
336 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.351204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01448  hypothetical protein  33.23 
 
 
336 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2179  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
336 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.77 
 
 
342 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1563  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
336 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2403  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
337 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
342 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
340 aa  132  9e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_68558  alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.02064  normal  0.599595 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.06 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 
344 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 
342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
347 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.23 
 
 
341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.54 
 
 
347 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
347 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
364 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 
356 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
364 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  29.72 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.85 
 
 
342 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.03 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0257  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1718  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.28 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271059  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.03 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  29.54 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1744  alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 
336 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>