29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44131 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44131  predicted protein  100 
 
 
1111 aa  2279    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847147  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44133  predicted protein  40.52 
 
 
1012 aa  775    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54411  predicted protein  38.16 
 
 
626 aa  188  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0187117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.22 
 
 
508 aa  61.6  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  27.67 
 
 
659 aa  55.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  26.75 
 
 
523 aa  55.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.89 
 
 
533 aa  54.3  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10661  5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14310)  27.62 
 
 
666 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.26 
 
 
523 aa  53.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  26.74 
 
 
657 aa  53.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  27.64 
 
 
575 aa  52.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.82 
 
 
627 aa  52.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  25.7 
 
 
523 aa  52  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  27.64 
 
 
574 aa  52  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  30 
 
 
505 aa  51.6  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  30 
 
 
500 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  27.33 
 
 
517 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  25.45 
 
 
529 aa  49.7  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.79 
 
 
587 aa  49.7  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  26.76 
 
 
512 aa  49.3  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  26.63 
 
 
556 aa  48.9  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  28.83 
 
 
552 aa  48.9  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.76 
 
 
508 aa  48.9  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.76 
 
 
508 aa  48.9  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.25 
 
 
872 aa  48.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3478  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.12 
 
 
508 aa  47.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622587  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.93 
 
 
515 aa  48.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05655  5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01160)  25 
 
 
498 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.511883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.76 
 
 
605 aa  47.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>