22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10271 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_10271  predicted protein  100 
 
 		 82 aa  175  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804871  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_9831  predicted protein  53.01 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.320101 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10394  anaphase promoting complex subunit Apc11, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01380)  51.9 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.136684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86664  ubiquitin-protein ligase Anaphase Promoting Complex  48.94 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04200  ubiquitin-protein ligase, putative  38.46 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.267821  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39090  predicted protein  32.95 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119493  RING-box protein 1  33.33 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0313077  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37145  Skp1 Cullin-F-box ubiquitin protein ligase (SCF) subunit  34.88 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08844  RING-box protein 1 (Broad)  30.23 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.43925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  37.1 
 
 		 341 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  38.98 
 
 		 1025 aa  47.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  38.33 
 
 		 637 aa  47.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03140  ubiquitin-protein ligase, putative  30.43 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0134629  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  31.94 
 
 		 568 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04130  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 		 559 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0558219  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 		 740 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18578  predicted protein  30.99 
 
 		 1744 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00349248  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  31.88 
 
 		 442 aa  40.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  51.72 
 
 		 611 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  50 
 
 		 831 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36079  predicted protein  30 
 
 		 565 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  28.99 
 
 		 376 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>