69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48866 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48866  predicted protein  100 
 
 
327 aa  680    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01590  regulation of amino acid metabolism-related protein, putative  43.9 
 
 
450 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0433818  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39512  predicted protein  43.7 
 
 
274 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0377472 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08173  Impact family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G03000)  38.81 
 
 
341 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627119  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33634  predicted protein  43.18 
 
 
96 aa  63.2  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.540309  normal  0.671015 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60871  predicted protein  30.87 
 
 
151 aa  62.8  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  34.02 
 
 
211 aa  60.8  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1014  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.250849  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  31.97 
 
 
193 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  30.91 
 
 
198 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  34.34 
 
 
197 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1261  hypothetical protein  38.1 
 
 
124 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  25.76 
 
 
205 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0699  hypothetical protein  30.83 
 
 
126 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0928683  normal  0.0143499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  32.03 
 
 
212 aa  52.8  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0046  hypothetical protein  26.95 
 
 
191 aa  52  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  29 
 
 
211 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  29 
 
 
211 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  29 
 
 
211 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  29 
 
 
211 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  29 
 
 
211 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  29 
 
 
211 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  31.25 
 
 
232 aa  51.6  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  29 
 
 
211 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  24.78 
 
 
205 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  28.69 
 
 
210 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  35 
 
 
200 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  32.32 
 
 
198 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  26.26 
 
 
208 aa  50.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.33 
 
 
208 aa  49.7  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  26.53 
 
 
192 aa  49.3  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  34 
 
 
206 aa  49.3  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  28 
 
 
211 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  30 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  31.31 
 
 
198 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  26.45 
 
 
207 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  28 
 
 
211 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  30.61 
 
 
216 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  31.43 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  31.43 
 
 
194 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  31.43 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  26 
 
 
206 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  32.32 
 
 
198 aa  47  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03580  expressed protein  27.55 
 
 
309 aa  47  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.805406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  31.73 
 
 
194 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  28 
 
 
211 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  27 
 
 
212 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  29.46 
 
 
192 aa  46.6  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  24 
 
 
205 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  32.71 
 
 
203 aa  46.2  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  25.62 
 
 
213 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  26.27 
 
 
192 aa  46.2  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  28.43 
 
 
221 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  30.93 
 
 
201 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  31.63 
 
 
191 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  30.61 
 
 
206 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  27.84 
 
 
212 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  24.79 
 
 
195 aa  43.9  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  32.74 
 
 
213 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  34.44 
 
 
172 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  28.79 
 
 
198 aa  43.5  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  27 
 
 
213 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  30.39 
 
 
225 aa  43.5  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  28.91 
 
 
210 aa  43.1  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  27.84 
 
 
214 aa  43.1  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  30.61 
 
 
201 aa  42.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  29.29 
 
 
211 aa  42.7  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  25.71 
 
 
216 aa  42.4  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>