30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48565 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  100 
 
 
648 aa  1281    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  39.23 
 
 
1000 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  48.28 
 
 
590 aa  103  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  32.84 
 
 
504 aa  78.6  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3648  hypothetical protein  33.09 
 
 
1616 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33213  predicted protein  39.78 
 
 
200 aa  65.5  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.906365  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  41.35 
 
 
479 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40917  predicted protein  54.44 
 
 
180 aa  64.3  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.251783  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47260  predicted protein  35.04 
 
 
398 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.776237  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  26.67 
 
 
1394 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  33.75 
 
 
830 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  25.69 
 
 
916 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.62 
 
 
2313 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  24.06 
 
 
3670 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  37.21 
 
 
1461 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41393  predicted protein  38.78 
 
 
222 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49933  predicted protein  52.54 
 
 
162 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_8524  predicted protein  52.31 
 
 
65 aa  51.6  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0570066  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49602  predicted protein  41.33 
 
 
558 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2400  hypothetical protein  26.51 
 
 
611 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150385  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  26.61 
 
 
840 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43595  predicted protein  31.36 
 
 
329 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.796402  normal  0.0151385 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47561  predicted protein  41.49 
 
 
521 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  43.86 
 
 
812 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1165  serine/threonine protein kinase  35.94 
 
 
713 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47888  predicted protein  40.78 
 
 
854 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.554333  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44659  predicted protein  45.16 
 
 
406 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.452156  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  38.18 
 
 
422 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000768502  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47872  predicted protein  40 
 
 
340 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147983  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  32.83 
 
 
1096 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>