20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45757 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45757  predicted protein  100 
 
 
530 aa  1107    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846436  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45174  predicted protein  44.7 
 
 
473 aa  366  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5893  hypothetical protein  30.36 
 
 
340 aa  154  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153704  hitchhiker  0.000842042 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48970  predicted protein  28.44 
 
 
440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26163  predicted protein  27.9 
 
 
433 aa  104  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.321729  hitchhiker  0.000660944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3408  alkaline phosphatase D domain-containing protein  25.83 
 
 
370 aa  97.1  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4422  alkaline phosphatase D domain-containing protein  25.38 
 
 
369 aa  94  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45959  phosphodiesterase/alkaline phosphatase  27.63 
 
 
507 aa  91.3  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.825873  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3028  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  23.33 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3815  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.34 
 
 
637 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1400  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  31.82 
 
 
458 aa  54.3  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0461  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  23.64 
 
 
469 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00298068  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0226  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  21.54 
 
 
471 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549857  normal  0.430349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  31.54 
 
 
523 aa  51.6  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  32.11 
 
 
534 aa  51.2  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  32.11 
 
 
534 aa  50.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  27.97 
 
 
558 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  29.82 
 
 
549 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  29.36 
 
 
523 aa  43.9  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  31.25 
 
 
522 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>