17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43159 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43159  predicted protein  100 
 
 
2413 aa  4991    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280738  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48121  predicted protein  49.41 
 
 
1874 aa  94.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43759  predicted protein  30.59 
 
 
462 aa  55.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14985  hypothetical protein, contains no bromo domain  37.93 
 
 
1474 aa  53.5  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07300  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16810)  46.67 
 
 
841 aa  53.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202225  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59773  conserved hypothetical protein  42.55 
 
 
651 aa  51.2  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06675  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05250)  36.36 
 
 
1173 aa  50.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0408152 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07294  PHD and RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16870)  40.82 
 
 
614 aa  49.7  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0466722 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29003  predicted protein  38.46 
 
 
831 aa  48.9  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.596418  normal  0.417698 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43517  predicted protein  38.36 
 
 
1255 aa  48.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220601  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48135  predicted protein  45 
 
 
840 aa  48.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.525832  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00240  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 
940 aa  48.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0793418  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37523  predicted protein  46.51 
 
 
1325 aa  48.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.706155  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45954  predicted protein  25.27 
 
 
1041 aa  47.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31122  predicted protein  31.71 
 
 
1197 aa  47.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  34.92 
 
 
1064 aa  47  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119675  TrxG-related PHD-finger protein  31.88 
 
 
705 aa  46.6  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>