More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_31650 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_31650  solute carrier  100 
 
 
590 aa  1180    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15984  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3177  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.24 
 
 
528 aa  307  3e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1096  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.59 
 
 
532 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1007  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.44 
 
 
533 aa  297  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.34 
 
 
507 aa  286  5.999999999999999e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.740673  normal  0.297493 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0418  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.1 
 
 
464 aa  247  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1511  uracil-xanthine permease  32.56 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0982636  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0895  uracil-xanthine permease  32.98 
 
 
413 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  29.31 
 
 
451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0206  uracil-xanthine permease  32.45 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1705  uracil-xanthine permease  31.4 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.297144  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  28.54 
 
 
458 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  26.8 
 
 
825 aa  127  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  29.18 
 
 
446 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  30.14 
 
 
438 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  30.93 
 
 
431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  30.11 
 
 
457 aa  120  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  26.6 
 
 
647 aa  120  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  29.64 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  28.61 
 
 
444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4724  xanthine permease  26.03 
 
 
518 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0102171  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  29.68 
 
 
458 aa  117  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  30.67 
 
 
457 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  30.67 
 
 
457 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  27.85 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  30.5 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0429  uracil-xanthine permease  27.58 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000136785  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  27.56 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  30.5 
 
 
458 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  30.5 
 
 
458 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  30.41 
 
 
395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  28.93 
 
 
501 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  30.25 
 
 
458 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  27.36 
 
 
487 aa  114  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  25.41 
 
 
525 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  25.41 
 
 
525 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04600  uracil-xanthine permease  25.94 
 
 
467 aa  113  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0641313  hitchhiker  0.000000425239 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  30.25 
 
 
458 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06450  uracil-xanthine permease  26.91 
 
 
469 aa  113  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.285171  normal  0.461399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  30.25 
 
 
458 aa  113  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  30.26 
 
 
469 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  25.41 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  25.41 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  25.41 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  25.41 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  25.41 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  25.41 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  29.98 
 
 
479 aa  111  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  25.47 
 
 
452 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  30.94 
 
 
469 aa  111  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  31.42 
 
 
469 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  25.63 
 
 
452 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  25.47 
 
 
452 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  31.09 
 
 
471 aa  110  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  31.19 
 
 
469 aa  107  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  28.87 
 
 
465 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  27.72 
 
 
466 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  26.89 
 
 
633 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  25.24 
 
 
665 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2606  uracil-xanthine permease  30.66 
 
 
478 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.03048  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  26.46 
 
 
463 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2327  uracil-xanthine permease  26.65 
 
 
468 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  28.39 
 
 
399 aa  103  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0943  uracil-xanthine permease  25.44 
 
 
436 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  28.99 
 
 
468 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  28.39 
 
 
399 aa  103  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1980  uracil-xanthine permease  29.29 
 
 
418 aa  103  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472534  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  27.74 
 
 
466 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  27.74 
 
 
466 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  26.25 
 
 
433 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0672  uracil-xanthine permease  29.72 
 
 
415 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  25.71 
 
 
460 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  26.32 
 
 
415 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  26.89 
 
 
423 aa  101  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  27.3 
 
 
417 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  27.56 
 
 
432 aa  100  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  27.61 
 
 
465 aa  100  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  27.58 
 
 
461 aa  100  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  25.8 
 
 
403 aa  100  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  27.18 
 
 
432 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  26.43 
 
 
457 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  24.94 
 
 
440 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  27.73 
 
 
409 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3202  uracil permease  28.26 
 
 
474 aa  97.8  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324856  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0910  uracil-xanthine permease  28.01 
 
 
428 aa  97.4  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327811 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  27.42 
 
 
463 aa  97.1  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  25.53 
 
 
462 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1891  uracil-xanthine permease  27.91 
 
 
394 aa  96.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  25.37 
 
 
451 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  25.37 
 
 
451 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  25.94 
 
 
451 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  27.51 
 
 
435 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  27.51 
 
 
435 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  25.58 
 
 
463 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  27.11 
 
 
411 aa  95.5  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  23.32 
 
 
452 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  27.2 
 
 
497 aa  94.7  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  25.06 
 
 
440 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  25.34 
 
 
448 aa  94.7  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  25.52 
 
 
440 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>