18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_2382 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  100 
 
 
253 aa  459  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  43.22 
 
 
1034 aa  149  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  42.26 
 
 
344 aa  112  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  39.22 
 
 
347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37425  predicted protein  42.68 
 
 
1569 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61446  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  40.55 
 
 
245 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15060  predicted protein  40.39 
 
 
191 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  35.79 
 
 
952 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50095  predicted protein  51.67 
 
 
982 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34245  predicted protein  42.86 
 
 
164 aa  55.5  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7107  hypothetical protein  28.38 
 
 
829 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  32.52 
 
 
3670 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.57 
 
 
761 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  28.93 
 
 
429 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  30.89 
 
 
421 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_1800  predicted protein  34.54 
 
 
284 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38100  predicted protein  33.63 
 
 
133 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0272  hypothetical protein  40.62 
 
 
310 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.514892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>