35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4712 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 139 aa  288  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  33.58 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2282  hypothetical protein  34.35 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182969  normal  0.14017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  31.88 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  28.68 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  28.99 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 		 402 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  29.85 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  31.45 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2313  hypothetical protein  28.47 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  29.2 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3271  hypothetical protein  28.06 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  30.83 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  25.4 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.85 
 
 		 316 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3702  hypothetical protein  29.31 
 
 		 331 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0491552  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0645  hypothetical protein  29.03 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272642  normal  0.0449232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  26.79 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  27.34 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  29.81 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  29.41 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  24.81 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2241  hypothetical protein  31.53 
 
 		 344 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  32.93 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  30.08 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  24.81 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  32.22 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  23.62 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  24.41 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1161  protein of unknown function DUF1486  26.56 
 
 		 180 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  37.8 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  30.56 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  26.52 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  25.4 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  28.12 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>