37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4486 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  100 
 
 		 60 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2010  CsbD-like  73.33 
 
 		 60 aa  92  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000265907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  70 
 
 		 60 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3234  CsbD family protein  63.33 
 
 		 60 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5261  hypothetical protein  65 
 
 		 60 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.197207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3271  CsbD family protein  55 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1403  hypothetical protein  50.85 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  42.86 
 
 		 57 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  39.62 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  41.51 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  41.51 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  41.51 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  41.51 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  35.19 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  37.74 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  33.93 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  35.85 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  33.33 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  40 
 
 		 67 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0833  hypothetical protein  37.74 
 
 		 79 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000181755  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  36.67 
 
 		 61 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  38.46 
 
 		 74 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  33.93 
 
 		 69 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  35.19 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  32.14 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  42.11 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  41.51 
 
 		 55 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  36.84 
 
 		 57 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  36.84 
 
 		 57 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  36.84 
 
 		 57 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  41.67 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  33.93 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  30.36 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  35.71 
 
 		 58 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  39.62 
 
 		 65 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>