57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3641 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3641  ferredoxin  100 
 
 
79 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1654  ferredoxin  77.22 
 
 
79 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1627  ferredoxin  77.22 
 
 
79 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0197  ferredoxin  67.09 
 
 
79 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.508683  normal  0.459083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3956  ferredoxin  66.23 
 
 
77 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0689877  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3856  ferredoxin  60.76 
 
 
79 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0540  ferredoxin  62.03 
 
 
79 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2102  NAD-reducing hydrogenase gamma  60 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.705334  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1260  hypothetical protein  45.21 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13381  hypothetical protein  46.15 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13281  hypothetical protein  39.73 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08351  hypothetical protein  41.67 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13531  hypothetical protein  36.25 
 
 
84 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.430148  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1597  hypothetical protein  41.77 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.241699  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0772  hypothetical protein  39.74 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0765  hypothetical protein  39.24 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.11271 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16131  hypothetical protein  39.74 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12381  hypothetical protein  48.39 
 
 
81 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.156899  normal  0.010521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.62 
 
 
346 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2902  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.58 
 
 
349 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.68 
 
 
917 aa  47.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3559  p-cymene monooxygenase, reductase subunit(CymAb)  39.58 
 
 
349 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393821  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.83 
 
 
374 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.86 
 
 
363 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.11 
 
 
381 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  45.83 
 
 
760 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1593  putative ferredoxin NAD(+) reductase  44.23 
 
 
332 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  44.9 
 
 
360 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.82 
 
 
372 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  40.82 
 
 
357 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.86 
 
 
366 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.99 
 
 
1073 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  41.67 
 
 
356 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  43.14 
 
 
630 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  45.1 
 
 
350 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  38.46 
 
 
354 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.46 
 
 
354 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  39.22 
 
 
622 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  42.86 
 
 
381 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  38.78 
 
 
247 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2100  ferredoxin  31.94 
 
 
609 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.624892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  38.78 
 
 
360 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  38.78 
 
 
360 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3208  Pdr/VanB family oxidoreductase  41.86 
 
 
314 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  40.82 
 
 
108 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.18 
 
 
363 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1001  hypothetical protein  38.6 
 
 
308 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000133962 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  36.76 
 
 
783 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  36.76 
 
 
783 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4453  hypothetical protein  36.84 
 
 
306 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000883054 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.82 
 
 
927 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  35.29 
 
 
343 aa  40  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  39.53 
 
 
366 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0938  hypothetical protein  36.84 
 
 
306 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0899  hypothetical protein  36.84 
 
 
306 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  38 
 
 
638 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  41.86 
 
 
353 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>